Enam tekitab alati probleeme varude inventeerimine. Varud on nii tooraine/materjal, lõpetamata ja valmistoodang ning müügiks ostetud kaubad. Kõik varud tuleb füüsiliselt üle lugeda ja veenduda nende seisukorras.
Riigikontroll tegi märkuse riigi majandusaasta koondaruande auditis Kaitseministeeriumi aruande kohta ja jättis varude saldole ning kaitseotstarbelise abi vahendamise seaduslikkusele hinnangu andmata.